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构建和使用整合单细胞图谱,需要考虑哪些因素?

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2025-02-13 10:34
    

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Basic Information 英文标题:Considerations for building and using integrated single-cell atlases 中文标题:构建和使用整合单细胞图谱的考虑因素 发表日期:13 December 2024 文章类型:Review Article 所属期刊:Nature Methods 文章作者:Karin Hrovatin | Malte D. Luecken 文章链接:https://www.nature.com/articles/s41592-024-02532-y Abstract Para_01 单细胞技术的迅速采用为构建整合多个实验室多样化数据集的单细胞‘图谱’提供了机会。 这些图谱可以作为分析和解释当前及未来数据的参考。 然而,很明显,不同的图谱构建方法存在差异,而这些差异的影响往往不明确。 在这里,我们回顾了当前的图谱文献,并提出了构建和使用图谱时需要考虑的因素。 重要的是,我们发现并不存在适用于所有情况的单一图谱构建协议,而是讨论了特定情境下的考虑因素和工作流程,包括图谱的概念化、数据收 ………………………………

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