Nat. Chem. Biol.｜使用MP3-seq对蛋白质-蛋白质相互作用进行大规模并行测量

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今天分享一篇发表在 Nature Chemical Biology 上的文章 Massively parallel measurement of protein–protein interactions by sequencing using MP3-seq 。文章的通讯作者是来自斯洛文尼亚卢布尔雅那大学 Ajasja  Ljubetic ̌ 助理教授和 美国华盛顿大学的 Georg Seelig 教授。 识别或者设计蛋白-蛋白相互作用（PPI）能够帮助理解这些蛋白参与的相关生物学过程，而一些正交的PPI还提供了通过调节PPI来进行治疗或者细胞改造的工具。早期的PPI研究设计主要关注单螺旋结构蛋白之间的相互作用（1x1s），而近期也有针对包含多个螺旋结构的更复杂的异二聚体之间的相互作用（2x2s）的研究。目前，已有多种方法实现对这些相互作用的检测，比如在实验上基于酵母双杂交（Y2H）的Alpha-seq方法，以及在计算模拟上基于AlphaFold2或者AlphaFold-Multimer等模型的虚拟筛选方法。 在本文中，作者设计了一种基 ………………………………