实用功能 | 到底要测多少数据？才能de novo组装一个基因组

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写在前面 不时有朋友问我，「我有某某材料，想测他的基因组，该怎么测，测多少数据？」。这是一个好问题，当然，我们完全可以问一下不同公司提供测序方案和价格，但这个多少不方便。不然朋友们也不会跑来问我，对否？ 但是呢，每次都讨论一下物种的情况，比如基因组大小，倍性，杂合度等等，这总是占用许多时间。同时如果我自己有一个新的材料基因组要测，也需要每次计算一下，然后又找朋友讨论。 为此，我灵机一动， 为啥我不找基因组组装项目经验非常丰富的小伙伴讨论，然后基于他的经验，形成一个「测序方案推荐功能」呢？ 说干就干，我找了「大壮」。聊了大概一个多小时，形成了一个判断逻辑和计算方案。上午我实现了下述 TBtools 新功能。 Genome Assembly Sequencing Data Size Recommend 简单计算器，基于用户输入的基因组大小评估 ………………………………