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高效单细胞数据分析easySCF

生信技能树  · 公众号  ·  · 2024-12-05 16:59
    

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摘要 总结 研究介绍了工具 easySCF ,旨在增强2个主要生物信息学平台R和Python之间的单细胞数据互操作性。支持无缝数据交换,easySCF提高了单细胞数据分析的效率和准确性。 关于 Python和R编程语言的优先级 的讨论实在是太多了, 小朋友才做选择,成年人就是全都学!我们有: 掌握Python,解锁单细胞数据的无限可能 ,也有: 生信入门 & 数据挖掘线上直播课12月班 ,掌握多种编程语言更方便应对各种生物信息学数据分析场合! 可用性和实施 easySCF利用统一的数据格式(.h5)来促进R和Python平台之间的数据传输。 该工具已经过数据处理速度、内存效率和磁盘使用情况的评估,以及处理大规模单细胞数据集的能力。easySCF实现细节和文档见 https://github.com/xleizi/easySCF 方法 图1  a) 数据转换示意图。b) scRNA和c) Visium HD处理时间测试。 图2  数据存储结构示意图 结 ………………………………

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