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6+孟德尔+共定位+单细胞,喂到嘴边的好思路,感兴趣快来复现!!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-07-20 18:02

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Comprehensive mendelian randomization analysis of plasma proteomics to identify new therapeutic targets for the treatment of coronary heart disease and myocardial infarction ”,这篇文章发表在 J Transl Med 期刊上,影响因子为6.1。 结果: MR分析 在这项研究中,蛋白质的 F 统计量大于 10,表明有很强的工具变量。cis-pQTLs的PVE从0.12%到81.9%不等。在发现阶段,使用 IVW 或 Wald 比率方法,1667 种血浆蛋白与 CHD 有因果关系(图2a 和附表S1)。13种血浆蛋白与冠心病有显著的因果关系(P < 0.05/1667)。该蛋白的PVE大于冠心病。此外,Steiger检验表明MR估计没有反向因果关联的证据。具体来说,遗传预测某些蛋白质水平的增加,例如脂蛋白 (a) (LPA) [比值比 (OR) = 1.23,95% 置信区间 (95% CI):1.15–1.32,P = 5.7E-10]、载脂蛋白 B (APOB)(OR = 2.14,95% CI:1.63–2.81 ………………………………

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