Nat. Commun. | 跨空间组学上进行增强分辨率的组织表征

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DRUG AI 今天为大家介绍的是来自邓岳/戴琼海团队的一篇论文。近年来，空间组学技术的进步已经扩展了被分析的分子类别范围，不再局限于转录组学。然而，这些技术中的许多由于空间分辨率有限，限制了我们深入表征复杂组织结构的能力。现有的计算方法主要集中于提高转录组学数据的分辨率，但缺乏应对新兴空间组学技术的适应性。在此，作者介绍了一种名为soScope的统一生成框架，旨在提升从各种空间技术中获得的分子谱的质量和空间分辨率。soScope通过分布先验进行特定组学的建模，整合了来自组学、空间关系和图像的多模态组织信息，并联合推断出增强分辨率的组学谱。在Visium、Xenium、spatial-CUT 和slide-DNA/RNA-seq等多种空间组学平台上的全面评估中，soScope提高了在识别具有生物学意义的肠道和肾脏结构、揭示在原始分辨率下无法解析的胚胎 ………………………………