主要观点总结
本文主要介绍了基因组技术背景下,遗传测试的变异分类和重新分类的重要性及其过程。文中提到了遗传变异的五个等级分类,强调了变异重新分类是在分析的变异评估阶段收集信息的过程,并涉及到一系列资源为评估变异与特定疾病相关联的某一类别的可能性提供证据。文章还讨论了与变异重新分类相关的因素,包括标准化指南、分离分析、临床表现、祖源、数据库、生物信息学、基因组重分析、伦理和法律等问题。最后,文章强调变异重新分类的临床影响以及它所带来的不确定性和挑战。
关键观点总结
关键观点1: 遗传测试在临床医学中的重要性及其背景
随着基因组技术的不断扩大和遗传测试在临床医学中的广泛应用,对患者进行准确分子遗传诊断的重要性日益凸显。遗传测试注册记录了大量的遗传测试和疾病,涵盖了广泛的基因。当前最广泛采用的序列变异分类系统仍然是2015年由美国医学遗传学学会(ACMG)和分子病理学协会(AMP)发布的指南。
关键观点2: 遗传变异的分类和重新分类
遗传测试发现的遗传变异主要分为良性、可能良性、不确定意义、可能致病和致病五个等级。变异重新分类是随着时间推移重新分配变异的致病性的过程。随着基因组知识的演进和用于分类变异的信息的积累,任何之前已经分类的变异都可以从一个类别重新分类到另一个类别。这个过程是基因组医学的一个特点,代表了不断演进的文献体系。
关键观点3: 变异重新分类的相关因素
在对序列变异进行分类(和重新分类)时,没有金标准测试来确定其致病性。因此,科学家和临床医生依赖一系列资源来为评估变异与特定疾病相关联的某一类别的可能性提供证据。这些资源包括标准化指南、分离分析、临床表现、祖源、数据库、生物信息学工具、基因组重分析等。
关键观点4: 变异重新分类的临床影响
变异重新分类的临床影响是多样的,可以加强终身医疗监控,促使预防性手术或医疗治疗,为精准医疗提供信息,并延长患有罕见疾病的患者的诊断时间。然而,这个过程也带来了不确定性和挑战,需要谨慎的咨询和持续的护理者。
文章预览
背景介绍 在临床医生可以使用的基因组技术范围不断扩大,以及遗传测试越来越多地用于临床诊断的背景下,体现了对患者进行准确分子遗传诊断的重要性。遗传测试注册记录了74,313种遗传测试,涵盖了24,204种疾病,覆盖了18,726个基因(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gtr/ 访问日期为2024年1月14日)。目前最广泛采用的序列变异分类系统仍然是2015年由美国医学遗传学学会(ACMG)和分子病理学协会(AMP)发布的指南。在遗传测试中发现的遗传变异主要分为良性、可能良性、不确定意义、可能致病和致病五个等级。根据2015年ACMG/AMP指南的建议,如果遗传变异不太可能与疾病相关(>90%的确定性不与疾病相关),则应将其分类为良性或可能良性变异;不确定意义的变异(VUS)没有足够的证据被分类为可能致病/致病或可能良性/良性;如果遗传变异被认为是致病的(>9
………………………………