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7+机器学习+分型+单细胞+实验验证,可重复,此种思路正流行!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2025-02-28 18:00
    

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“Effects of COL1A1 and SYTL2 on inflammatory cell infiltration and poor extracellular matrix remodeling of the vascular wall in thoracic aortic aneurysm”,这篇文章发表在 Chin Med J (Engl) 期刊上,影响因子为7.5。 结果: 二甘醇筛选 在GSE 9106数据集中,作者分析了59个TAA和34个正常外周血细胞样本,使用“limma”软件包在两组之间识别出21个DEG。在GSE 26155数据集中,作者分析了43例TAA和43例正常主动脉壁组织样本,并使用“limma”软件包在两组之间识别出21个DEG。将临界值调整为P值0.5。 DEG的富集和功能相关性分析 维恩图分别从外周血和动脉壁组织中识别出GSE 9106和GSE 26155的16种常见DEG(coDEG)[图1A]。GO分析的DEG表明,在生物过程中的前三名的条款包括胸腺中的T细胞分化的正调控,磷脂酰肌醇3-激酶信号的调节,和胸腺中的T细胞分化的调节。细胞组 ………………………………

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