教程 | 我研究的蛋白结合金属吗？

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如果你正在研究一个蛋白，怀疑它可能结合了金属，并且想进一步探究金属的结合位点，甚至你希望知道这个位点具体结合什么金属，这篇文章可能可以帮助到你。 最近看到一个刚刚发表的PDB结构，8K7P，上面居然有Zn2+、Ca2+、Mg2+三个离子，就拿它做个例子。 先去uniprot上看看 研究一个蛋白先看看有没有已知信息。在uniprot上，我们看到这个蛋白已经有两个已知的金属结合位点，同时PDB上也有这个蛋白的同源结构，故事结束。 再用MetalNet试试 当然我们可以假装不知道（这是一条广告），用我组开发的MetalNet（ 号外 | 王初课题组与苏晓东课题组合作发展基于共进化和机器学习的蛋白质金属结合位点预测新方法 ，服务器地址为https://www.chem.pku.edu.cn/wangchulab/resourses/）提交序列进行预测。 初始并没有预测打分超过0.8的位点，但观察左边列表，可以看到排名 ………………………………