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传统的bulk转录组测序并没有没落,虽然说大家都在抢单细胞的热点! 单细胞技术基本上变革了生命科学领域的ngs研究,以前我们可以针对大队列癌症病人做多组学数据,其中佼佼者就是TCGA计划,然后各个组学可以独立分析或者联合分析。 比如根据表达量情况把病人分型,比如乳腺癌的分子分型:你可以看lumA、lumB、basal、HER2 等亚型,其中TNBC可以继续细分为3~7种亚型。现在有了单细胞转录组数据的加持,细胞亚型会越来越清晰。如果要整合多组学数据,分类也会更加复杂。 但是呢,传统的bulk转录组测序,其实虽然说测序的样品仍然是肿瘤组织,但是它是一个复杂的生态系统,不仅仅是有恶性的肿瘤细胞,还有围绕它的各式各样的免疫细胞,以及以内皮细胞和成纤维
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