ASCPsra: 让你的SRA下载飞起来

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默认从ena上直接拉取fq，而且支持多线程批量下载、断点续传、文件md5校验和重新下载 将速铂下载工具进行封装，以便高效方便地批量下载SRA测序数据。 本脚本试图将速铂进行封装，实现只需提供SRA的ID号，即可完成序列下载和转换。 参考文章： SRA、SAM以及Fastq文件高速下载方法 。 更新信息 默认下载源更新为ENA ENA下载fastq文件实现了自动的md5校验，且通过md5校验信息，自动识别ID对应的测序文件是单端还是双端 程序安装与环境部署 获取程序 输入下面的命令： git clone https : //gitee.com/wangshun1121/ASCPsra.git perl ./ ASCPsra . pl - h 若一切安装就绪，则会显示帮助信息。若部分组件未部署好，则程序会有提示。 依赖的perl modules安装 需要安装 Parallel::ForkManager 和 Parallel::Simple 两 ………………………………