Nature | 利用lentiMPRA技术大规模解码人类转录调控元件

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撰文 | 格格 顺式基因调控元件 （ cCREs ） 是调控基因表达的DNA序列，它们在健康和疾病中起着至关重要的作用 【1】 。然而，人类基因组中包含数百万个cCREs （candidate cis-regulatory element） ，其中许多具有组织或细胞类型特异性，其功能特征尚不清楚。cCREs中的序列变异是许多人类疾病的主要诱因，例如大多数全基因组关联研究 （GWAS） 都涉及包含远端cCREs （如增强子） 的非编码单倍型。因此，理解cCREs的功能和变异效应对于疾病研究和治疗至关重要。 目前，对cCREs功能的理解主要依赖于描述性方法，例如基因组范围的开放染色质、转录因子结合、组蛋白修饰和mRNA表达水平的鉴定 【2】 。这些方法虽然能够发现大量的cCREs，但无法确认任何给定的cCREs是否具有功能性。大规模并行报告实验 （MPRA） 可以克服这些局限性，它通过在多路复用方式下测试 ………………………………