NBT｜NIS-Seq：实现光学检测干扰筛选

文章预览

撰文 | 十一月 遗传扰动筛选 可以通过在细胞中移除随机的基因进行基因型和表型的分析，由此可以破译基因之间的关系。光学干扰筛选通过利用荧光显微镜为遗传扰动筛选提供了广泛的选择。特定的基因扰动可以确定目标基因的生物学功能。通过CRISPR筛选与荧光显微镜相结合可以提供一定的空间分辨率，然而更为精细的亚细胞结构可能会导致筛选出现结果不一致的情况。 基于原位杂交测序的光学扰动筛选可以对基因功能进行多维度的解析，但是该方法仍然有两个主要的局限。第一，因为测序依赖于细胞质中的mRNA分子，转录活性较低或者体积较小的细胞信号较低，因而排除了在某些细胞类型中的适用性。其次，细胞必须被透性化，才能进行原位杂交实验。 为了解决这些局限，近日，德国波恩大学 Jonathan L. Schmid-Burgk 研究组在 Nature Biotechnology 上发 ………………………………