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16S数据应用情景 筛选与环境因子密切相关的物种

基迪奥生物  · 公众号  ·  · 2025-01-03 18:12
    

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微生物群落不是独立存在于周围环境中,环境因子的变化会引起群落结构和功能的改变。在16S数据分析中,利用环境因子分析可以预测微生物群落结构与生态机制,通过筛选环境检测或畜牧品质等方面的关键微生物,进而为污染控制或食品安全等问题提供参考与指导。然而,环境因子与微生物数据关联的分析点很多,怎样合理地利用各个分析点进行排列组合,解决研究中遇到的问题呢?小编给大家总结了常见的分析思路,在实际的数据挖掘中根据自身研究目的的不同,对不同的分析点进行组合,形成不同的应用方案。 图1 分析思路 在研究中,我们通常关心两个问题:1.哪些环境因子驱动微生物的丰度变化?2.特定微生物是否对特定环境因子做出响应?今天给大家分享的这两篇 基迪奥客户文章 通过 筛选环境因子(多样性差异)+筛选关键物种(丰度 ………………………………

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