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美国克利夫兰医学中心程飞雄教授团队Nature Communications:基础模型鉴定了针对耐药细菌感染的广谱抗菌肽

抗菌科技圈  · 公众号  ·  · 2024-09-22 07:30

主要观点总结

本文介绍了一项研究,研究者开发了一种基于肽语言的深度生成框架(deepAMP)来识别有效的广谱抗菌肽(AMPs),以克服抗菌素耐药性危机。通过两轮设计,鉴定并合成了18种T1-AMP和11种T2-AMP候选药物,并进行了实验测试。这些AMPs在感染铜绿假单胞菌的雌性伤口小鼠模型中表现出有效的抗菌活性。研究表明,deepAMP具有发现针对耐药细菌的有效、广谱AMPs的潜力。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景

抗菌肽的优化发现对于克服抗菌素耐药性危机至关重要。作者开发了一种名为deepAMP的深度生成框架,用于识别有效的广谱AMPs。

关键观点2: 研究方法

作者使用deepAMP框架来设计和合成AMPs候选药物,并通过实验验证其抗菌活性。使用了交叉优化验证,并对候选药物进行了体外和体内模型的实验验证。

关键观点3: 研究结果

超过90%的设计AMPs对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌表现出比渗透素更好的抑制作用。其中,T2-9显示出最强的抗菌活性,可与FDA批准的抗生素相媲美。此外,三种AMPs(T1-2、T1-5和T2-10)显着降低了对金黄色葡萄球菌的耐药性,并在感染铜绿假单胞菌的雌性伤口小鼠模型中表现出有效的抗菌活性。

关键观点4: 研究亮点

deepAMP框架在优化AMPs方面表现出卓越的性能,证明了其效率、准确性和识别潜在AMPs的能力。此外,该框架还确定了具有强抗菌活性和低毒性的候选AMPs。

关键观点5: 研究展望

虽然deepAMP框架在发现有效的AMPs方面取得了显著的成果,但仍需要进一步的实验验证和体内观察来确认其疗效和安全性。未来的研究将致力于开发多模态肽生成方法来捕获肽的序列和3D结构信息,并提高模型的可解释性。


文章预览

第一作者: Tingting Li 通讯作者:曾湘祥,史俊峰,程飞雄 通讯单位:湖南大学,美国克利夫兰医学中心 研究速览 开发强效广谱抗菌肽(AMPs)有助于克服抗菌素耐药性危机。作者开发了一种基于肽语言的深度生成框架(deepAMP),用于识别有效的广谱AMPs。使用deepAMP来降低抗菌药物耐药性并增强AMPs的膜破坏能力,作者在两轮设计中鉴定、合成并通过实验测试了18种T1-AMP(第1层)和11种T2-AMP(第2层)候选药物,并通过采用交叉优化验证。超过90%的设计AMPs对革兰氏阳性菌(即金黄色葡萄球菌)和革兰氏阴性菌(即肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌)表现出比渗透素更好的抑制作用。T2-9显示出最强的抗菌活性,可与FDA批准的抗生素相媲美。作者发现,与环丙沙星相比,三种AMPs(T1-2、T1-5和T2-10)显着降低了对金黄色葡萄球菌的耐药性,并且在感染铜绿假单胞菌 ………………………………

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