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【PNAS】中国农大在植物中实现转录调控序列的人工智能设计

iPlants  · 公众号  ·  · 2024-06-19 22:03
    

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来源:中国农大 近日,在“农作物基因资源阐析”国际大科学计划(G2P计划)等项目的支持下,中国农业大学农学院汪海团队联合美国康奈尔大学、丹麦奥胡斯大学、北京大学现代农业研究院、坦桑尼亚农业科学院等单位,在PNAS在线发表了题为“Modeling 0.6 million genes for the rational design of functional cis -regulatory variants and de novo design of cis -regulatory sequences”的研究论文(www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2319811121)。 尽管转录调控已被发现了半个多世纪,人类仍然无法像理解编码区DNA序列的密码子那样,理解转录调控区DNA序列中每个碱基的功能。如何给DNA序列加上“标点符号”以定义motif?Motif的数量、类别、方向、组合、顺序以何种数学函数映射到基因的表达量?这些问题(即转录调控区的语法)至今未能总结为普适而简约的定律。这一基础理论问题的滞后限制 ………………………………

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