DRUG-seq：一种用于药物开发和挖掘的高通量测序技术

文章预览

基因扰动的数字RNA (Digital RNA with pertUrbation of Genes，DRUG-seq) ，即高通量药物筛选RNA测序，这是一种用于药物发现的高通量平台。该技术于2018年发表于 Nature Communication 杂志。 药物发现依赖于高通量筛选，但当前平台的读数有限。RNA-seq是一种使用转录组变化作为代理来研究药物效果的强大工具，但标准文库构建成本高昂。 DRUG-seq以1/100的成本捕获在标准RNA-seq中检测到的转录变化。在对8种剂量的433种化合物进行分析的概念验证实验中，从DRUG-seq生成的转录谱成功地根据化合物的预期靶标 ，根据作用机制 (MoA)将化合物分组为功能簇。 在针对同一靶标的化合物中检测到了转录组变化中反映的扰动差异，证明了使用DRUG-seq来了解靶标和非靶标活动的价值。证明了DRUG-seq可以捕获常见机制，以及化合物治疗和 CRISPR 对同一靶标的差异。 通过DRUG-seq技术能对不同 ………………………………