GSEA软件使用入门

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官网 http://software.broadinstitute.org/gsea/index.jsp 官网下载 http://software.broadinstitute.org/gsea/downloads.jsp 安装前需要安装好java环境 官网说明书 http://software.broadinstitute.org/gsea/doc/desktop_tutorial.jsp  首先我们先了解一下什么叫做基因富集分析  基因富集分析是分析基因表达信息的一种方法，富集是指将基因按照先验知识，也就是基因组注释信息进行分类。 2005年提出了基于基因集(gene set)定义的基因富集分析方法。  首先要定义基因集，也就是基于我们的先验知识（基因组注释信息），将基因富集，可以想象成，用一堆代表基因功能的箱子（bin）把具有相同或相似功能的基因装起来，起到了降维的作用，当然，每个基因可能同时参与好几种功能。 这样，得到这两组数据后， ………………………………