专栏名称: 生信分析手册
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共病+机器学习+分子对接,想做共病思路的可作为模版!!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-11-25 18:09

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“The shared mechanism and potential diagnostic markers for premature ovarian failure and dry eye disease”,这篇文章发表在 Sci Rep 期刊上,影响因子为3.8。 结果: 全球环境展望信息 从 GEO 中筛选出与 DED 和 POF 相关的数据集,获得符合研究条件的基因芯片数据集GSE44101(微阵列平台GPL1261)、GSE39501(微阵列平台GPL6887)、GSE171043(微阵列平台GPL28441)和GSE48873(微阵列平台GPL13607)。这些数据集包含正常样本和疾病样本。经过筛选,作者选择了与 DED 相关的数据集GSE44101进行分析,并选择了GSE171043进行验证;选择了与 POF 相关的数据集GSE39501进行分析,并选择了GSE48873进行验证。 DED 和 POF 的加权基因共表达网络分析(WGCNA) 对GSE44101和GSE39501数据集的数据进行预处理后分析,得到样本聚类。选取β值分别为20和9作为构建共表达网络的软阈 ………………………………

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