单细胞实战！除了鉴定新类群，Frequency有差异或表达有差异也是不错的！

文章预览

在单细胞数据分析中，Fig1一般是流程图、分群、聚类。从Fig2开始，数据分析开始呈现出差别，一般的文章可能会采用总-分结构进行描述性展示；好的文章则 结合实验或表型， 注重数据深度挖掘。2020年7月，Immunity杂志发表题为Single-cell sequencing of peripheral blood mononuclear cells revealsdistinct immune response landscapes of COVID-19 and influenza patients的研究论文，探究COVID-19和流感患者的不同免疫应答情况。 不出所料，Fig1进行流程展示和细胞的分群聚类，包括展示各个样本的细胞数。 基于细胞标记物，鉴定出PBMC中的 T 细胞、B 细胞、单核细胞、NK细胞、DC和巨核细胞。 其中T 细胞包括Naive T细胞，活化CD4 + T细胞，Effector CD8 + T 细胞，MAIT细胞和循环 T 细胞；浆细胞、循环浆细胞和记忆B细胞；NK细胞；DC和单核细胞。 接下来，作者首先对比了各个样本中细胞亚群的Frequenc ………………………………