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实验解析|蛋白质序列对比与结构预测如何入门?

实验老司机  · 公众号  ·  · 2024-11-27 07:00
    

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做蛋白质功能、信号通路、疾病靶点与作用机制,乃至于筛选新药物靶标蛋白质及其结合位点等课题,都有一项基础的需求:分析比对蛋白质序列和预测蛋白质结构。 因为肽链的氨基酸序列本身以及蛋白质的高级结构都会很大程度影响到它的最终功能。光做实验收获数据可能会没有处理头绪,因此我们需要生物信息学(bioinfo)手段。 Bioinfo作为一个学科近年已越发成熟,如今拥有大量的数据分析方法和理论模型,推动蛋白质研究的发展。 在这里,小编给大家提供一个用于“分析比对蛋白质序列和预测蛋白质结构”的入门新手包: 图片来源:https://images.app.goo.gl/emPxHQPu9HhXqPq48 首先,在实验初期我们要获取蛋白质及其编码基因的序列数据。可以在这些网站获取: NCBI (National Center for Biotechnology Information): https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ NCBI包含很多子分类数据 ………………………………

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