Nat Commun丨刘瑾团队开发创新RNA速度分析方法SDEvelo

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单细胞RNA测序 （single-cell RNA sequencing, scRNA-seq） 技术的发展让我们能够在单细胞水平上研究基因表达，但由于测序过程的破坏性特点，研究人员只能获得某一时间点的”快照”，难以追踪细胞发育的动态过程。虽然RNA速度分析方法 （RNA velocity analysis） 可以通过比较未剪切RNA （unspliced RNA） 和已剪切RNA （spliced RNA） 的比例来预测细胞的瞬时发展方向，但现有方法往往忽视了多基因间的多变量建模，且对转录动力学中的随机性考虑不足，可能导致细胞命运方向的错误预测。 近日，香港中文大学 (深圳) 数据科学学院 刘瑾 课题组与武汉大学 焦雨领 课题组在 Nature Communications 发表了题为 Multivariate stochastic modeling for transcriptional dynamics with cell-specific latent time using SDEvelo 的研究文章，该研究 开发了一种名为SDEvelo的创新RNA速度分析方法，通过多变量随机微 ………………………………