scTPA|单细胞转录组网页分析神器

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今天给大家介绍一款基于人和小鼠细胞簇生物通路激活的单细胞转录组分析与注释的在线网页工具：scTPA。这个数据库是由温州医科大学苏建忠教授课题组开发，并发表在Bioinformatics期刊上。scTPA收集了大量不同分类且具有不同生物学功能的生物通路，这有助于识别细胞簇的关键通路特征来鉴定和解释细胞类型的注释。下面我们将来介绍一下怎么使用这款网页工具。 一、网页地址： scTPA - Home (bio-data.cn)  二、工作流程概要 三、导入数据 首先我们进入网页，映入眼帘的就是如下图所示scTPA的操作界面，非常简洁，所有的操作可以分成5个过程： ①选择物种：物种选择只有人和小鼠两种。 ②单细胞表达矩阵：需要提供如下图所示第一列是基因名称，列名是细胞名称的矩阵文件，文件接受txt或csv格式，可以接受.zip，.tar，.tar.gz压缩格式。scTPA可以自动识别 ………………………………