专栏名称: 生信分析手册
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5+机器学习+单细胞+实验,又是一篇卷创新的范文,思路可借鉴!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-12-13 18:00
    

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“Identification and verification of diagnostic biomarkers for deep infiltrating endometriosis based on machine learning algorithms”,这篇文章发表在 J Biol Eng 期刊上,影响因子为5.7。 结果: DIE和非DIE中DEG的筛选 图1显示了流程图。在GSE 141549数据集中,对77个DIE样品和71个NON-DIE样品进行差异表达分析。在鉴定的148个DEG中,根据以下筛选标准,38个基因显著上调:|log 2倍数变化(FC)|> 0.585且P值 < 0.05,而没有观察到基因显著下调。生成GSE 141549数据集中DIE和NON-DIE之间DEG的热图和火山图。热图显示,DIE组中大多数DEG均上调,特别是USP 14、LRRFIP 1、C20 ORF 127、HSPA 1A和FTHL 12(图2A)。火山图显示22个上调基因,其中10个基因,包括USP 14、HSPA 1A、FTHL 12、USP 49、A2 M、LRRIP 1、C20 ORF 127、SEMA 3C、RH 0 B和NR 4 A2,显著上调(图2B)。 差异基因的GO和KEGG富集分 ………………………………

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