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代谢组学的整洁分析流程-tidymass-3-massdata常用操作

灵活胖子的科研进步之路  · 公众号  ·  · 2024-09-03 00:22

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第三部分  使用其他工具创建 mass_dataset 类 如果你不想使用 massprocesser 进行原始数据处理,你完全可以使用其他工具(如 mzMine 或 MS-DIAL)。然后你可以使用 massdataset 包中的函数将这些工具的结果转换为 mass_dataset 类。 mzMine 特征表到 mass_dataset 类 我们还可以直接将 mzMine 的特征表转换为 mass_dataset 类。 以下是 mzMine 的示例特征表: row ID row m/z row retention time 10232_P4_RE4_01_476.mzXML Peak area 10765_P4_RE9_01_482.mzXML Peak area 10546_P4_RG11_01_515.mzXML Peak area 11035_P4_RB4_01_431.mzXML Peak area 11163_P4_RB11_01_439.mzXML Peak area 13541_P4_RG3_01_506.mzXML Peak area 10712_P4_RH3_01_521.mzXML Peak area 10715_P4_RA4_01_415.mzXML Peak area 11111_P4_RB1_01_428.mzXML Peak area 14153_P4_RH8_01_526.mzXML Peak area 18404_P3_RF6_01_370.mzXML Peak area 16500_P2_RD8_01_209.mzXML Peak area 13917_P4_RA10_01_423.mzXML Peak area 16501_P2_RD9_01_210.mzXML Peak area 14880_P3_RA3_01_ ………………………………

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