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样本量爆棚?分析深度加码?选对服务器,省心科研无忧!

生信塔  · 公众号  ·  · 2024-10-31 18:00
    

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嘿,聊到服务器配置,要是自个儿在实验室买,要记得选那种“高配款”,不然通过设备科升级,那可有的折腾了。未雨绸缪,留点缓冲空间总是明智的。不过嘛,若你在咱们这租个在线服务器,那就轻松多了,开个账户,售后群里喊一嗓子,今天说明天就能用上,跟变魔术似的。 再说宏基因组测序,样本不多时,64线程配256G内存的服务器就游刃有余。但要是样本超过30个,嘿,你就需要提升到96线程,512G内存了。为啥?因为宏基因组测序是个内存大户,组装、去冗余那会儿,算力需求蹭蹭涨,分析复杂度也跟着飙升,需要的软件和数据库支持一个都不能少。 来看看单细胞分析。基础操作,比如读取数据、质控啥的,一个样本大概1万个细胞,占2G内存。样本少于30个的话,72线程配256G内存就够了。不过,如果你想玩深度分析,比如伪时序分析,那 ………………………………

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