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检索和预测miRNA靶基因及其结合位点的几个数据库 miRNA ( microRNA )是一类非编码的小 RNA 分子,通过与靶基因的 mRNA 结合,参与调控基因表达。 miRNA 的靶基因的 mRNA 通常在其 3' 非翻译区( 3' untranslated region , 3'UTR )包含与 miRNA 的序列互补的区域,这种互补性可以导致 miRNA 完全或部分与靶基因的 mRNA 的 3'UTR 区结合影响其稳定性或翻译,最终导致 mRNA 的降解或翻译抑制。 miRNA 的靶基因是多种多样的,一个 miRNA 可能会同时调控多个靶基因,而一个基因也可能受到多个 miRNA 的调控。在生物信息学分析中,通常通过分析 miRNA 序列和靶基因转录本的互补配对位点来识别可能的 miRNA- 靶基因关系。 本篇简介几种常用于检索和预测 miRNA 的靶基因以及二者结合位点的数据库,包括 TargetScan 、 miRDB 、 miRNet 、 miRWalk 。 使用TargetScan预测miRNA的靶基因 TargetScan (
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