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Introduction 自己整理一些常用的功能基因预测/注释通用工具，因为数量较多，不会写的很仔细，对于每个单独的工具可以进一步找相关教程学习。 基因结构鉴定工具 Prodigal 参考教程： 一文读懂Prodigal教程 [1] 介绍 ： Prodigal（Prokaryotic Dynamic Programming Gene-finding Algorithm）是一款用于原核生物基因预测的高效工具，广泛应用于基因组和宏基因组数据分析。 安装 ： # 下载并解压源代码包： wget https://github.com/hyattpd/Prodigal/releases/download/v2.6.3/prodigal.linux chmod +x prodigal.linux sudo mv prodigal.linux /usr/local/bin/prodigal # 或者直接用 conda 安装： conda install prodigal 简单使用 ： 1. 基因组序列文件中预测基因： prodigal -i input.fasta -o genes.gbk -a proteins.faa GeneMark 参考教程： • GeneMark-ES [2] • GeneMarkS [3] 介绍 ： GeneMark是一款通用的基因预测工具，适用于原核和真
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