专栏名称: 生信分析手册
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7.2分生信,胶质瘤+铜死亡热点+结合实验验证,构建铜死亡相关预后模型!!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-07-26 18:06

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Cuprotosis clusters predict prognosis and immunotherapy response in low-grade glioma”,这篇文章发表在 Apoptosis 期刊上,影响因子为7.2。 结果: LGG中的铜死亡基因突变概况 在这项研究中,作者首先着重分析了18个铜死亡基因(NLRP3,ATP7A,ATP7B,SLC31A1,FDX1,LIAS,LIPT1,LIPT2,DLD,DLAT,PDHA1,PDHB,GLS,GCSH,MTF1,CDKN2A,DBT和DLST)在LGG患者中的基因突变,并观察到LGG样本中突变的低频率。在506个样本中,只有12个(2.37%)的 铜 死亡 基因发生了改变,而这些改变的频率低于等于1%(图2A)。具体而言,CDKN2A的突变频率最高,为1%,而其他基因没有突变(图2A)。还分析了 铜 死亡 基因在染色体上的CNV改变位置(图2B),发现CDKN2A,DLST和ATP7B基因常见发生CNV缺失,而DLD和PDHA1基因更常见发生CNV扩增(图2C)。此外,作者发现与正常组织 ………………………………

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