医学博士,R语言及Python爱好者,科研方向为真实世界研究,生信分析与人工智能研究。
今天看啥  ›  专栏  ›  灵活胖子的科研进步之路

tidyplots学习超详细注释版-基于Cursor-(6)

灵活胖子的科研进步之路  · 公众号  ·  · 2025-01-14 00:00
    

文章预览

教程首页 热图 热图是绘制跨两个附加变量的连续变量的好方法。为了举例说明这一点,我们将看看gene_expression数据集。 gene_expression %>%    dplyr::glimpse() gene_expression %>%  group_by(sample) %>%  count() %>%  head() 我们将首先在samplevariable中绘制每个external_gene_name的表达式值。 gene_expression %>%    tidyplot(x = sample, y = external_gene_name, color = expression) %>%    add_heatmap() 这里需要注意的一点是y轴标签是重叠的。所以让我们将绘图区域的高度从50毫米增加到100毫米。 gene_expression %>%    tidyplot(x = sample, y = external_gene_name, color = expression) %>%    add_heatmap() %>%   adjust_size(height = 100) 接下来要注意的是,像Map1a和Kif1a这样的一些行显示非常高的值,而其他行显示的值要低得多。让我们应用一种经典技术来为每行中的差异保留颜色范围。这是通过单独计算每 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览