Nat Methods | 何爱彬/舒绍坤团队开发同时检测药物基因组靶点与表观基因组的单细胞方法scEpiChem

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导语 小分子可以调节细胞过程，并影响基因表达、染色质结构和信号通路功能。这些相互作用为包括传统疗法与靶向治疗等干预措施奠定了基础。虽然目前医学界已证实许多小分子药物可以与基因组相互作用起效，但其中具体机制仍不清楚。因此，绘制小分子结合DNA或染色质相关蛋白的图谱对于破译其在抗癌治疗中的作用至关重要。 目前为止，只有少数几种技术被报道可用于检测大样本中小分子和细胞DNA之间的相互作用，而这些技术动辄需要数百万个细胞。迄今为止，小分子靶点结合的单细胞分析尚未实现。Protein A-Tn5（pA-Tn5）将Protein A与经过工程学改造的超高活性Tn5转座酶进行融合，形成同时具备转座酶与Protein A活性的新型融合酶，可兼容单细胞，具有DNA片段化活性较高、纯度高等特点，常用于研究蛋白质-基因组互作。 2024年7月18日，北京大学 ………………………………