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《Nature》:体内追踪解析发育和癌前过程

immunity速读  · 公众号  ·  · 2024-10-31 16:04
    

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昨天,范德比尔特大学 Ken S. Lau 、 Robert J. Coffey 共同通讯在《 Nature 》发表论文“ Temporal recording of mammalian development and precancer ”,利用单细胞 CRISPR 平台提出了一种分子钟方法,用于在体内记录细胞事件和克隆性。研究揭示了哺乳动物发育和癌前病变的关键方面,将合成的或天然的不可磨灭的( indelible )基因变化与单细胞分析相结合。 在开发时间记录平台时,作者设计了一种用于非多聚腺苷酸化 hgRNAs 的定制捕获平台( NSC-seq ),展示了高效的 gRNA 检测能力以及追踪突变的能力。研究发现,突变密度而非频率是单细胞应用的有用指标。作者通过体细胞线粒体变异体( mtVars )增加 hgRNA 突变信息,进一步增强了追踪能力,从而能够准确识别小鼠胚胎中的细胞谱系和发育阶段。 谱系和细胞分裂追踪揭示了早期发育的相关信息。对早期胚胎突变( EEMs ………………………………

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