单细胞多样品分析2-标记基因与细胞注释

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单细胞测序—标准流程代码(2) — 标记基因与细胞注释 书接上回—— 单细胞多样品标准流程代码-1 ，已经做好 数据质控、过滤、去批次、降维聚类分群 后，接下来就是进行细胞注释方面的工作 step4:  看标记基因库 # 原则上分辨率是需要自己肉眼判断，取决于个人经验 # 为了省力，我们直接看  0.1和0.8即可 table(Idents(sce.all.int))     0      1      2      3      4      5   5241   4859   1365   1261   1062    138   table(sce.all.int$seurat_clusters)     0      1      2      3      4      5      6      7      8      9     10     11     12     13     14   2460   2200   1998   1878   1061    936    690    635    598    511    428    241    139     92     59   table(sce.all.int$RNA_snn_res.0.1)      0      1      2      3      4      5   5241   4859   ………………………………