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北科大本科生科研团队在Nature Communications上发表论文-转录组学分析全生态算法框架OmicVerse
生信技能树
·
公众号
· · 2024-07-24 08:17
文章预览
单细胞RNA测序(scRNA-seq)和Bulk RNA测序( RNA-seq )是探索细胞异质性、发育分化和疾病机制的重要技术。由于测序平台的技术限制以及酶解过程造成的细胞丢失,某些细胞类型在单细胞测序中有时会被遗漏,例如足细胞、中间祖细胞、神经元等。 因此,开发能够应对单细胞数据中“遗漏”情况的算法工具,对于推动单细胞组学分析具有极其重要的意义。 此外,尽管组学算法的种类和数量不断增加,但选择合适的工具——既要准确无误,又要易于使用,且适合特定分析需求——却变得越来越困难。用户在学习和应用各种组学算法时,往往需要适应不同的系统,这不仅增加了计算和分析的复杂性,也降低了效率。 因此,当前单细胞组学分析领域急需一个全面的算法框架,该框架应能简化对bulk RNA-seq和scRNA-seq分析的多种模型和算法的访问,从而提取关 ………………………………
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