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如何绘制文献同款功能富集网络图?

SCIPainter  · 公众号  ·  · 2024-08-22 11:07

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在较多文献中,时常能看到下图这般的富集网络图,用于展示目标基因集所在的通路及其关联性。那么这样的富集网络图是如何绘制的? Fig1( Nat Commun ,2024) Fig2( Aquaculture and Fisheries ,2023) 该富集网络图基于 一款免费的基因注释与分析在线工具——Metascape 自动生成,只要目标基因集在手,我们可以轻轻松松get到同款! Metascape: https://metascape.org/gp/index.html 进入Metascape官网后,需上传目标基因集。支持Gene lD/symbol/RefSeg/Ensembl/UniProt /UCSC六类基因ID,可上传基因ID文件,也可直接复制粘贴到gene list输入框中。这里我们点击 Select File... 上传ID文件,格式如下: 上传基因集后,在Step2中选择对应物种,在Step3中点击 Express Analysis ,可开始分析。 静待片刻分析完成后,点击 Analysis Report Page 可进入Metascape的基因list在线分析报告,所有结果全部一览无余! 在 ………………………………

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