PNAS：谢晓亮课题组开发新型单细胞甲基化与羟甲基化测序技术

文章预览

DNA甲基化的建立与去除通常关系到基因表达水平的变化，也会参与胚胎发育、疾病发生等过程。伴随二代测序技术进步，基于重亚硫酸盐（bisulfite）转化的全基因组DNA甲基化测序技术出现并且成为研究者观测基因组范围内DNA甲基化修饰分布的重要工具。陆续出现的单细胞DNA甲基化测序技术也多数基于重亚硫酸盐转化反应。然而，重亚硫酸盐会造成基因组DNA的严重片段化甚至降解，受此影响，基于重亚硫酸盐转化反应的单细胞DNA甲基化测序技术有低基因组覆盖率的缺点，同时由于重亚硫酸盐转化不能对甲基化（5mC）与羟甲基化（5hmC）修饰进行区分，在多能性细胞群（早期胚胎、胚胎干细胞）和神经细胞等羟甲基化修饰含量丰富的细胞类型中难以准确表征DNA甲基化修饰状态。因此，开发高基因组覆盖度的单细胞甲基化与羟甲基化测序技术是非常必要的 ………………………………