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Science封面文章 | 新方法实现单细胞分辨率的全脑三维成像,进行全脑空间转录分析

测序中国  · 公众号  ·  · 2024-12-23 14:48
    

主要观点总结

本文报道了一种新技术TRISCO,该技术能够实现全脑范围内的RNA三维成像,具有单细胞分辨率。TRISCO结合了组织清除技术和原位杂交链式反应(isHCR),可用于研究小鼠胚胎、大脑切片和临床活检组织中的RNA。该技术被用于全脑的空间转录分析,揭示整个大脑的转录图谱,并成功应用于啮齿动物和人的各种组织。TRISCO的开发为神经科学领域提供了实质性的进步,使人们能够更详细和全面地了解完整大脑中的基因表达。

关键观点总结

关键观点1: TRISCO技术的特点

TRISCO是一种结合组织清除技术和isHCR的新技术,用于全脑范围内的RNA三维成像,具有单细胞分辨率。它能够实现整个大脑的转录分析,揭示整个大脑的转录图谱。

关键观点2: TRISCO技术的应用

TRISCO已成功应用于小鼠、大鼠和豚鼠的大脑,以及人胎儿的大脑半球。它可以检测各种细胞类型中的典型转录物表达,并揭示特定的基因表达模式和复杂的转录模式。

关键观点3: TRISCO的潜力

TRISCO具有广泛的应用潜力,包括转基因动物的表型分析、探索复杂的三维结构、评估活性调节基因转录和进行药物测试等。


文章预览

导读 全脑范围内分子的三维成像对于理解细胞的空间关系及其参与的回路至关重要。目前,虽然已经发表了多种组织清除方案用于成像,但其中绝大多数侧重于评估蛋白质的分布,而不是RNA转录本。尽管一些新开发的技术试图将RNA成像与组织清除结合起来,但将其应用于更大的组织或器官,如整个哺乳动物的大脑,仍然具有挑战性。 2020年6月,瑞典卡罗林斯卡学院的研究团队在 Nature Biomedical Engineering 发文报道了新开发的原位免疫荧光标记清除肿瘤样本诊断技术DIIFCO,该技术结合原位杂交链式反应HCR(isHCR)和有机溶剂清除技术,可用于研究小鼠胚胎、大脑切片和临床活检组织中的RNA,但是这种方法在完整的大脑中可视化RNA仍不可行。 近日,该团队在国际顶尖期刊 Science 发表了题为“Whole-brain spatial transcriptional analysis at cellular resolution”的文章,报 ………………………………

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