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三招组合拿下宏基因组群落组成分析

基迪奥生物  · 公众号  ·  · 2024-08-16 18:00
    

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游戏中常常有华丽的组合技,通过不同招式的组合拿下Boss顺利通关。与游戏中的组合技一样, 物种分布 、 Alpha多样性 与 Beta多样性分析 通常是评估 分组间物种群落组成整体差异 常用的分析模块,它们往往组合在一起出现,作为连招一击拿下宏基因组群落组成分析。下面我们就通过一篇基迪奥客户文章,一起来看看怎么将这些“招式”组合在一起,拿下群落组成分析吧! 图1 基迪奥客户文章-物种群落组成分析 [1] 图2 基迪奥客户文章群落组成分析应用的分析点 第一招 观察物种数量—Alapha多样性分析 第一招先从“物种量”的层面拆解群落组成,宏基因组通常能够识别上千个微生物物种,Alpha多样性分析主要是评估样本中微生物种/属水平物种的数量, 进而可以通过统计检验判断不同分组间的物种量是否有显著差异 。Chao1和ACE指数仅仅能反映物种数 ………………………………

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