西湖大学张骊駻组Chem. Sci.｜模块型聚酮天然产物挖掘的代谢-基因组学策略

主要观点总结

近日，西湖大学理学院张骊駻团队在《Chemical Science》上发表了关于代谢基因组学策略挖掘模块型聚酮产物的论文。研究团队采用负离子质谱分析策略，从链霉菌株 Streptomyces cattleya 中发现了多个聚酮类产物。该策略为聚酮产物的挖掘提供了有效手段，有助于加速发现重要的生物活性分子。

关键观点总结

关键观点1: 研究团队开发了一种基于负离子质量亏损过滤（NegMDF）的代谢基因组学方法，用于模块型聚酮产物的快速筛选。

该方法通过预测目标基因簇相应产物的大致范围，即质量亏损过滤窗口（MDF window），来缩小目标产物的候选离子数量，提高了分析的效率。

关键观点2: 研究通过对微生物代谢组的分析，发现了多个聚酮类产物，其中一些是以前未报道过的。

这些发现展示了该策略在挖掘微生物天然产物中的有效性。

关键观点3: 该研究得到了西湖大学未来产业研究中心、浙江省“尖兵”“领雁”研发计划以及国家自然科学基金的支持。

这些资助为研究的进行提供了重要的支持。

文章预览

遇见/摘要 近日，西湖大学理学院 张骊駻 团队在《 Chemical Science 》上发表了题为“ A Metabologenomics Strategy for Rapid Discovery of Polyketides Derived from Modular Polyketide Synthases ”的研究论文。 研究团队开发了一种生物信息学导向的负离子质谱分析策略，可用于模块型聚酮合酶的基因挖掘。该方法成功从一株有数十年研究历史的链霉菌株 Streptomyces cattleya 中发现了 22 个聚酮类产物，其中 18 个此前未报道过。这项研究为聚酮类产物的挖掘提供了一种代谢基因组学手段，有利于加速这类重要生物活性分子的发现。   图 1. 基于 NegMDF 策略的聚酮天然产物代谢基因学挖掘策略 遇见/ 内容 近年来，基因组导向的代谢组分析，即 代谢基因组学 ，日渐成为挖掘微 生物天然产物的有效手段。然而，如何在微生物代谢组中找到基因组所预测的产物，是如今天然产物发现的关键 ………………………………