博士生：科研人没暑假，我要卷！复旦中山医院团队“深度学习”辅助的“空间转录组+代谢重编程”思路，都卷上天了！

主要观点总结

文章介绍了复旦大学附属中山医院泌尿外科团队关于透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的代谢异质性的研究。研究结合了单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了肿瘤微环境中的代谢异质性。文章还介绍了开发的新工具scMet，用于加速scRNA-seq在癌症中的临床应用。本文主要分析了不同细胞类型和空间维度上的代谢异质性，以及糖酵解等代谢途径在肿瘤发生和T细胞免疫应答中的作用。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景与目的

文章旨在揭示透明细胞肾细胞癌的代谢异质性，通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术结合探究肿瘤微环境中的代谢变化。

关键观点2: 主要技术与数据

研究使用了空间转录组技术，结合了来自公共数据库如GEO、NCBI Gene Expression Omnibus datasets等的单细胞RNA测序数据。分析方法经典，适合小伙伴参考和复现。

关键观点3: 研究结果

研究发现了肿瘤微环境的异质性，揭示了不同的细胞浸润模式；糖酵解的复杂性及其对肿瘤发生的多种生物学影响；代谢动力学和糖酵解在CD8+ T细胞免疫应答中的相互作用；代谢异质性影响巨噬细胞在肿瘤微环境中的功能；ENPP2作为潜在的预后标志物和肿瘤源性内皮细胞指标；在ccRCC微环境中映射空间代谢活性的差异。

关键观点4: 研究意义

文章通过深入研究发现代谢异质性的复杂性，为未来的肿瘤治疗提供了新的视角和方法。此外，文章展示了scMet工具的能力，该工具可加速scRNA-seq在癌症中的临床应用。

文章预览

哈喽哈喽！又见面啦~我是你们的小塔！ 到暑假了 ，又是弯道冲刺的机会呢！ 毕竟很多时候实验停不下来，论文的压力也比较大，‘卷’不是自愿的，但是没有办法不加的。 今天小塔分享的文章非常经典，又是肿瘤与空间转录组的结合，是非常好的参考文献呢！赶紧跟我往下看吧！（ PS：懂小塔的意思吧？肿瘤+空间转录组，是不是 还 可以套用在很多肿瘤研究中呢？都是拿高分的好方法，快找小塔试试吧！ ） 文章题目是“Metabolic heterogeneity in clear cell renal cell carcinoma revealed by single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics”，由复旦大学附属中山医院泌尿外科团队带来的医学2区佳作。研究使用了空间转录组技术度肿瘤转录组数据结合进行探究与挖掘。主要使用的数据来源于公共数据库，分析方法比较 经典，非常适合小伙伴们进行参考和复现 。 本文聚 ………………………………