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引言 长读长RNA测序技术(long-read RNA-seq technologies, lrRNA-seq)的兴起引发了对其全面评估的需求。 为了评估长读长方法在转录组分析中的有效性,长读长RNA测序基因组注释评估项目(Long-read RNA-Seq Genome Annotation Assessment Project, LRGASP )应运而生。 该项目通过使用不同的测序协议和平台,生成了超过4.27亿条来自人类、小鼠和海牛物种的长读长序列数据 。这些数据集包括从互补DNA(cDNA)和直接RNA数据集中提取的长读长序列, 旨在解决转录本异构体(transcript isoform)检测、定量和新转录本检测中的挑战 。(6月7日 Nature Methods “ Systematic assessment of long-read RNA-seq methods for transcript identification and quantification ”) 该研究表明, 包含更长、更准确序列的文库能比那些仅增加读长深度的文库生成更准确的转录本,而增加读长深度则有助于提高定量准确性 。在注释
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