主要观点总结
本文介绍了在琼脂糖凝胶分析中未能观察到RT-PCR产物时可能的原因及解决方法。包括RNA质量、逆转录抑制剂、引物设计、反应条件等方面的问题,并给出了相应的处理建议。
关键观点总结
关键观点1: RNA质量与处理
RNA被降解、包含逆转录抑制剂等问题可能会影响RT-PCR结果。良好的RNA分离技术、立刻处理组织、使用胎盘RNase抑制剂等可以提高RNA质量。
关键观点2: 逆转录抑制剂的处理
通过乙醇沉淀RNA可以除去抑制剂,加入对照RNA以检验抑制剂的存在。
关键观点3: 引物设计与反应条件
引物退火温度、第一链合成反应温度等条件对RT-PCR结果有影响。选择合适的引物,调整反应温度,使用随机引物等可以改善结果。
关键观点4: 其他可能影响结果的因素
包括起始RNA量、RNA模板二级结构、引物或模板的敏感性、DNA抑制剂等也会影响RT-PCR结果。需要根据具体情况调整实验条件。
文章预览
在琼脂糖凝胶分析中看到少量或没有 RT-PCR 产物,可能有以下原因。 RNA 被降解 在用来验证完整性之前先在变性胶上分析 RNA。使用良好的无污染技术分离 RNA。在将组织从动物体取出后立刻处理。在 100% 甲酰胺中储存 RNA 如果使用胎盘 RNase 抑制剂,不要加热超过 45℃ 或 pH 超过 8.0,否则抑制剂或释放所有结合的 RNase。而且,在 ≥0.8 mM DTT 时加入 RNase 抑制剂,一定要存在 DTT。 RNA 中包含逆转录抑制剂 通过乙醇沉淀 RNA 除去抑制剂。用 70%(v/v)乙醇对 RNA 沉淀进行清洗。可以加入糖元(0.25 μg 到 0.4 μg/μl)以帮助小量样品 RNA 的恢复。 逆转录抑制剂包括:SDS,EDTA,甘油,焦磷酸钠,亚精胺,甲酰胺和胍盐。将对照 RNA 同样品混合,同对照 RNA 反应比较产量以检验抑制剂。 多糖同 RNA 共沉淀 使用氯化锂沉淀 RNA 以除去多糖。用于合成 cDNA 第一链合成的
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