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基迪奥生物  · 公众号  ·  · 2024-12-18 18:00
    

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前言 趋势分析是我们寻找目标基因/蛋白/代谢物的常用方法之一。Mfuzz和STEM是趋势分析的两种常见软件。其中,Mfuzz是基于模糊c均值聚类(Fuzzy C-Means Clustering, FCM)算法进行聚类,也叫soft clustering算法 [1] ;相比于K-means等hard clustering聚类方法,一定程度上降低了噪声对聚类结果的干扰。此外,相比于STEM预先设定出可能存在的代表性趋势,再将数据归类到与其最相似的趋势中 [2] ;Mfuzz通过模糊聚类算法来确定每个数据隶属于各个趋势的程度(即membership值),而不是将数据对象硬性地归类到某一个趋势中,在分组数量较多时能够更精准捕获数据的 代表性趋势 。 基迪奥 Omicsmart 在线报告( www . omicsmart . com )趋势分析已全面升级,包括转录组、蛋白组、代谢组、翻译组等,在原来STEM趋势分析的基础之上新增了Mfuzz软件的分析结果,而且支持对实验组和 ………………………………

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