文献分享｜Cell｜福尔马林固定石蜡包埋组织的空间RNA分析

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文献 分享 15 十一月 星期五 大家好！ 为大家介绍一篇 今年发表在 Cell 上的文献， 题目为“ Spatially exploring RNA biology in archival formalin-fixed paraffin-embedded tissues ”。 本文作者通过结合原位多聚腺苷酸化处理，微流控辅助的原位组织编码和计算创新，提出了一种适用于临床存档的甲醛固定石蜡包埋（ FFPE ）样本的空间全转录组测序技术—— Patho-DBiT 技术，为病理组织学研究提供了变革性的潜力。 该技术专门用于探测 FFPE 样本中多样的 RNA 种类，允许对基因表达和 RNA 处理进行空间共分析，揭示区域特异性剪接异构体，并可对已保存 5 年的临床肿瘤 FFPE 组织进行高灵敏度的转录组映射。 利用 Patho-DBiT 可以捕获全基因组单核苷酸 RNA 变异，绘制 RNA 调控网络和 RNA 剪接动态等。 Patho-DBiT 作为一个有前景的平台，有望揭开 FFPE 组织中丰富的 RNA 生物学，助力 ………………………………