仅有16S/ITS结果，能对微生物功能进行研究吗

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对于微生物生态学研究，我们最关注的无疑是菌群所具备的代谢功能。随着数据分析技术的发展，我们现在能通过已知的微生物基因组数据进行菌群代谢功能的预测，把物种的“ 身份 ” 和它们的“ 功能 ”对应起来。根据菌群代谢功能预测结果，一方面能窥探菌群功能谱的概貌，发挥扩增子测序性价比高的优势；另一方面也能帮助指导后续宏基因组测序等的实验设计，更合理地筛选用于后续研究的样本。然而各式各样的功能预测软件让人眼花缭乱，作为新手，我们该如何选择合适的软件对微生物功能进行预测呢？本期内容将针对微生物功能预测分析中的常见问题，为大家一一解答。 问题1 功能预测软件都有哪些？怎么选择？ 16S功能预测软件有四种，分别是PICRUSt、Tax4Fun、FAPROTAX、BugBase： ①PICRUSt 是基于Greengene数据库中OTU的进化树和基因信息，构 ………………………………