专栏名称: 单细胞天地
对应生信技能树论坛›研究热点›单细胞测序版块,力求全方位收集整理分享单细胞测序数据的应用,涵盖多种组学,多种疾病,发育机理,药物开发等等
今天看啥  ›  专栏  ›  单细胞天地

离大谱,单细胞转录组表达量矩阵会泄露个体基因型隐私?

单细胞天地  · 公众号  ·  · 2024-11-18 09:59

文章预览

单细胞转录组数据一般来说首先是有测序的fastq文件,这个跟普通转录组一样的,都是默认可以公开上传的。然后是表达量矩阵文件,更是必须得上传到数据库并且公开,因为没有提供表达量矩阵的单细胞研究往往是默认是造假的! 其实通常是基因组和外显子组等DNA测序数据比较严格管控 目前,基本上很难看到公开的基因组和外显子组等DNA测序数据的fastq文件啦,因为基因序列对于每个人来说都是独一无二的,因此可以作为有效的生物识别标识符。这种独特性可以实现跨数据集的同一个人的样本链接,从而增加重新识别和披露敏感健康信息的可能性。 因为基因型信息的敏感性已得到充分证实,只需 30 至 80 个独立的单核苷酸多态性 (SNP),在统计上就足以唯一地识别个体。尤其是罕见的基因变异提供了更强的识别信号。 此外,在家谱数据库中搜索亲 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览