主要观点总结
本文介绍了美国西奈山伊坎医学院的科研团队在 Nature Communications 发表的文章，该文章探究了串联重复序列（TRs）多等位基因变异对人类性状的影响。文章指出，过去的研究普遍关注二等位基因单核苷酸变异（SNV），但对于复杂基因组位点的多等位基因变异，GWAS的检测结果通常较差，这被认为是导致所谓“遗传性缺失”的原因。而TRs可能有助于解释这一缺失问题。
关键观点总结
关键观点1: 研究背景
过去的研究主要关注二等位基因单核苷酸变异（SNV），但对于复杂基因组位点的多等位基因变异的研究较少，这导致了所谓的“遗传性缺失”问题。
关键观点2: 研究目的
探究串联重复序列（TRs）多等位基因变异对人类性状的影响，并解释部分“遗传性缺失”问题。
关键观点3: 研究方法
对英国生物样本库（UKB）的个体进行TRs基因分型分析和全表型组关联研究（PheWAS），共识别出与性状表现出精细映射关联的TRs。
关键观点4: 研究结果
研究团队鉴定了多个TRs，并对其进行了基因型分析。通过PheWAS观察到显著TR与性状关联。大部分精细映射关联归因于常见的等位基因变异，而非罕见的扩增。验证分析表明，高置信度精细映射关联具有显著性，并与效应方向相同。
关键观点5: 研究意义
该研究首次对基因组中的TRs进行直接基因型分析和表型关联研究，发现了许多新的表型关联，并强调了多等位基因TR在解释基于SNV的GWAS“遗传性缺失”中的重要性。
文章预览
导读 在过去二十年中，已有数千项全基因组关联研究（GWAS）识别了影响各种人类特征的遗传变异，但多数研究普遍关注于二等位基因单核苷酸变异（SNV），对于可能包含多等位基因变异且突变率反复或高突变率的复杂基因组位点，GWAS的检测结果通常较差，这被认为是导致所谓“遗传性缺失”的原因。 作为一种未被充分研究的遗传变异类型，串联重复序列（TRs）可能有助于解释部分“遗传性缺失”问题，其包括短串联重复序列（STRs）和长串联重复序列（LTRs）两类。STRs的极端扩增已被认为是罕见神经退行性疾病和先天性疾病的原因；近期研究也表明，STRs和具有较大基序TRs的共同长度多态性可对基因组产生功能影响，导致基因表达、剪接和DNA甲基化的个体间差异。但由于缺乏能够进行大规模基因分型的技术，TRs经常被忽视。 近日，美国西奈山伊坎
………………………………
