Nat Commun | 基于UKB和All of Us队列的串联重复序列变异分析，揭秘人类基因组“遗传性缺失”

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导读 在过去二十年中，已有数千项全基因组关联研究（GWAS）识别了影响各种人类特征的遗传变异，但多数研究普遍关注于二等位基因单核苷酸变异（SNV），对于可能包含多等位基因变异且突变率反复或高突变率的复杂基因组位点，GWAS的检测结果通常较差，这被认为是导致所谓“遗传性缺失”的原因。 作为一种未被充分研究的遗传变异类型，串联重复序列（TRs）可能有助于解释部分“遗传性缺失”问题，其包括短串联重复序列（STRs）和长串联重复序列（LTRs）两类。STRs的极端扩增已被认为是罕见神经退行性疾病和先天性疾病的原因；近期研究也表明，STRs和具有较大基序TRs的共同长度多态性可对基因组产生功能影响，导致基因表达、剪接和DNA甲基化的个体间差异。但由于缺乏能够进行大规模基因分型的技术，TRs经常被忽视。 近日，美国西奈山伊坎 ………………………………