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如何进行差异分析与个性化火山图绘制?

SCIPainter  · 公众号  ·  · 2024-09-07 11:00

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差异分析(Differential Analysis) ,转录组等组学研究中最基础且核心的分析内容之一,我们一般会使用 edgeR 或 DESeq2 进行差异分析,再将结果使用火山图等图表进行可视化。作为组学小萌新: edgeR、DESeq2如何选择? 不会编程代码如何完成分析? 如何绘制高度个性化的发表级图表…… 莫担心!在 OmicShare云工具 (引用4500+的交互式在线数据分析可视化工具平台),已集成2大差异分析及火山图在内的162+生命科学期刊绘图必备工具,让你轻松get发表级图表! 1.edgeR/DESeq2差异分析 差异分析,以生物学意义的方式定性基因表达量,计算两个比较组的基因表达差异倍数(Fold change),得到显著性P值,然后通过多重假设检验矫正筛选出具有统计学意义的显著差异表达基因,从而为我们挑选目标基因缩小范围,再将结果与后续分析点相结合,如富集分析等,以探 ………………………………

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