都已经做单细胞转录组了为什么还要做普通转录组？

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前 言 单细胞转录组测序（scRNA-seq）是在单细胞水平上研究基因表达差异的技术，能使我们在单细胞分辨率研究细胞的异质性、发育分化和分子调控机制，但在RNA覆盖度和测序深度上不如普通转录组。而普通转录组测序（bulk RNA-seq）反映的是样本整体的基因转录情况，其RNA覆盖度和测序深度高，是针对基因的高精度研究。 因此，通过将scRNA-seq和bulk RNA-seq相结合，一方面可以将二者进行 优势互补 ，同时发挥scRNA-seq高分辨率和bulk RNA-seq高测序深度的优势，这有助于我们从双维度诠释细胞的分子机制；另一方面，二者的结果还能 互相验证 ，有助于后续的实验设计和验证，提高我们的研究深度，助力高分文章发表。今天，我们一起来聊一聊单细胞转录组和普通转录组的关联分析策略和应用思路。 实验设计思路 （1）先通过普通转录组确定 关键基因 ，再 ………………………………