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从msigdb下载的hallmark基因集里面的基因数量上限是200??

生信技能树  · 公众号  ·  · 2024-08-24 10:19

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最近有小伙伴反馈在做题的时候出现了一个百思不得其解的bug,是不同数据库的hallmark基因集的冲突,蛮适合我们的人工智能大模型答疑的专辑,所以我也视频演练了一下; 第一次提问:帮我介绍一下 msigdbr 包,以及它背后的msigdb数据库资源,分门别类 msigdbr 是一个 R 语言包,它提供了对 MSigDB(Molecular Signatures Database)的直接访问。MSigDB 是一个广泛使用的基因集合注释数据库,它包含了大量关于基因集的注释信息,这些信息可以用于各种基因表达分析,尤其是在癌症生物学、免疫学和其他基因组学研究领域。 MSigDB 概述: 全称 :Molecular Signatures Database。 目的 :提供基因集的注释信息,帮助研究者理解基因如何在生物学过程和疾病中协同作用。 内容 :包含多个子数据库,每个子数据库专注于不同类型的基因集和生物学主题。 MSigDB 的主要类别: C ………………………………

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